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Une étude met en lumière l’ancienne matière noire microbienne

Les bactéries se trouvent pratiquement partout, y compris la saleté, les sources chaudes, les océans et même à côté et à l’intérieur d’autres organismes comme les humains. Bien qu’ils soient essentiellement invisibles, ils ont un impact énorme sur presque tous les aspects de la vie sur Terre. Malgré leur abondance, on sait étonnamment peu de choses sur les nombreux micro-organismes qui existent depuis des milliards d’années.

Cela comprend une souche entière de bactéries de taille nanométrique appelée Omnitrophota. Découverte pour la première fois sur la base de courts fragments d’ADN il y a seulement 25 ans, cette bactérie est commune dans de nombreux environnements à travers le monde mais n’est pas bien comprise. jusqu’à maintenant. Une équipe de recherche internationale a produit la première analyse à grande échelle de plus de 400 génomes d’Omnitrophota nouvellement séquencés et existants, révélant de nouveaux détails sur leur biologie et leur comportement. Les découvertes de l’équipe sont publiées dans le numéro du 16 mars de la revue Nature Microbiology.

« Nous avons maintenant la vision la plus complète à ce jour de la biologie de tout un groupe de micro-organismes et du rôle étonnant qu’ils jouent dans les écosystèmes terrestres », a déclaré le microbiologiste de l’UNLV Brian Hedlund, auteur correspondant de l’étude. « Il existe un nombre limité de grandes lignées de vie sur notre planète, et il est passionnant d’en savoir plus sur les organismes qui sont antérieurs aux plantes et aux animaux et qui sont essentiellement cachés sous notre nez. » Le problème avec Omnitrophota est qu’ils sont encore largement considérés comme de la matière noire microbienne, ce qui signifie qu’ils existent dans la nature mais ne peuvent pas être cultivés comme une seule espèce dans les études en laboratoire. Seules deux espèces ont été observées au microscope, et seulement récemment.

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Pour fournir une image complète de leur biologie, les scientifiques ont comparé 349 génomes existants et 72 nouvellement cartographiés d’Omnitrophota. Cela comprenait un examen des données accessibles au public et de nouveaux échantillons prélevés dans des environnements géothermiques, des lacs d’eau douce, des eaux usées, des eaux souterraines et des sources situées dans le monde entier. L’équipe a noté que dans la plupart des cas, les Omnitrophota mesurent moins de 450 nanomètres, ce qui les place parmi les plus petits organismes connus. Ils ont également montré des signes génétiques compatibles avec la symbiose – peut-être en tant que prédateurs ou parasites d’autres micro-organismes, ce qui suggère qu’ils auraient des taux métaboliques élevés. En effet, lorsque l’absorption isotopique a été mesurée comme indicateur de l’activité métabolique, Omnitrophota était hyperactif.

« Comme nous en savons peu sur Omnitrophota, ils ont longtemps été cités par les écologistes microbiens. Notre objectif était de faire enfin sortir cette lignée de l’obscurité », a déclaré Cal Seymour, récent diplômé de la maîtrise UNLV et auteur principal de l’étude. « Plus nous en savons sur les voies et les modes de vie possibles en matière de conservation de l’énergie, plus nous nous rapprochons de notre objectif de les cultiver en laboratoire et de les éclairer. » Préféré

(Cette histoire n’a pas été éditée par l’équipe de Devdiscourse et a été générée automatiquement à partir d’un flux syndiqué.)

Delphine Perrault

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