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Présentation pour enquêter sur l’infection prolongée au COVID et la récidive du COVID

Comité permanent de la Chambre sur la santé, les soins aux personnes âgées et les sports

16 novembre 2022

Le Peter Doherty Institute for Infection and Immunity est une coentreprise non constituée en société entre l’Université de Melbourne et le Royal Melbourne Hospital, regroupant la recherche, l’enseignement, la santé publique, les services de laboratoire de référence, les services de diagnostic et les soins cliniques en maladies infectieuses et en immunologie.

Nous avons fourni des contributions et des commentaires principalement sur le terme de référence 3 : Recherche sur les effets potentiels et connus, les causes, les facteurs de risque, la prévalence, la gestion et le traitement de la COVID prolongée et/ou de la COVID récurrente en Australie.

Notre présentation comprend trois sections :

  1. Capacité de l’Institut Doherty
  2. Recommandations générales
  3. Recommandations pour le COVID-19 à long terme

1. Capacité de l’Institut Doherty

L’Institut Doherty possède une expérience de recherche bien établie et des relations utilisées pour lutter contre le COVID prolongé et récurrent, avec un leadership et une implication dans un certain nombre de projets en cours. Certains de ces projets et leurs contributions à la compréhension des COVID longs et récurrents incluent :

  • Professeur agrégé Vicki Lawson Il développe des modèles animaux précliniques de COVID-19, avec une expertise dans l’évaluation de l’impact neuroprotecteur de l’infection par le SRAS-CoV-2. En particulier, le MRFF dirige une bourse d’études pour explorer les effets neurologiques et cérébraux des variantes préoccupantes du SRAS-CoV-2. Le projet développera de nouveaux biomarqueurs sensibles et spécifiques pour les lésions cérébrales induites par des virus (objectif 1) et identifiera les déterminants viraux de la virulence neuronale (objectif 2) pour prédire l’effet neuroprotecteur des nouveaux COV émergents (objectif 3). Les collaborateurs comprennent des chercheurs de l’Institut Doherty et de l’Université La Trobe.
  • Professeur Stephen KentEt le Dr Adam Whitley Et le Dre Jennifer Juno Nous avons une collaboration à long terme avec l’UNSW pour explorer les conséquences immunologiques de l’infection par le SRAS-CoV-2 et avons contribué à une analyse complète des réponses immunitaires huit mois après l’infection par le SRAS-CoV-2. Cette analyse, utilisant des échantillons de la cohorte ADAPT et publiée dans L’immunité de la nature¹, que les cellules immunitaires innées sont fortement activées chez les sujets atteints de COVID prolongé, avec des déficits en lymphocytes T, en lymphocytes B naïfs et en interférons de type I et de type III. Ils étudient maintenant plus en détail la réponse des lymphocytes B. La cohorte ADAPT analysée comprenait 147 personnes, dont 31 avaient une COVID prolongée.
  • Dre Catherine Gibney Il est le chercheur principal (avec le professeur Margaret Hillard du Burnet Institute) de l’étude Optimize, une enquête de recherche mise en place en 2020 pour suivre la réponse COVID-19 de Victoria. Environ 700 participants à haut risque touchés par le COVID avec une approbation éthique ont été recrutés pour un contact ultérieur. Une enquête COVID rapide à long terme a été menée en août 2022, avec le rapport disponible sur le site de l’étude². Les résultats de l’enquête incluent le soutien à la poursuite des mesures de santé publique pour prévenir la COVID-19 prolongée, une proportion importante de personnes atteintes de COVID prolongée sans aucun diagnostic formel et les impacts généralisés du coronavirus sur la vie quotidienne des participants. L’étude Optimize a un bon engagement avec le ministère de la Santé de Victoria et a produit des rapports bimensuels.
  • Dr Irani Thevarajan Il a créé le programme Sentinel Travelers and Research Preparedness for Emerging Infectious Diseases (SETREP-ID) pour une étude pré-COVID, qui a été activée pour capturer des échantillons biologiques de cas de SRAS-CoV-2 hospitalisés en 2020. Depuis lors, ce groupe a depuis effectué un suivi longitudinal (mais en nombre modeste). Le Dr Thevarajan collabore avec les professeurs immunologistes Katherine Kedzierska et Dale Godfrey, avec un lien possible avec des échantillons supplémentaires via la professeure associée Sophie Valkenburg. Le groupe SETREP-ID soutient également des recherches examinant les conséquences cliniques dans le cadre du traitement et de la vaccination des adultes et des enfants infectés de longue date par le virus COVID.
  • La Partenariat australien pour la préparation de la recherche aux urgences liées aux maladies infectieuses (APRISE) Il est basé à l’Institut Doherty. APPRISE est un centre d’excellence pour la recherche financé par le NHMRC qui a reçu une subvention supplémentaire pour continuer via le ministère de la Santé du Commonwealth. Professeur Sharon Lewin Il est le chercheur principal avec plusieurs autres employés de Doherty impliqués. La subvention supplémentaire financera deux grands projets nationaux, dont un sur le COVID à long terme. APPRISE fait également progresser les capacités de la plate-forme pour la recherche sur les maladies infectieuses, y compris la création d’une biobanque virtuelle pour relier diverses collections d’échantillons biologiques pour la recherche en un seul endroit (y compris ADAPT et SETREP-ID).
  • par APPRISE, Professeur Judy McVernon a établi l’étude australienne First Few X (FFX) en 2020, comprenant un échantillonnage biologique et une analyse détaillée de la transmission domestique dans les 28 premiers jours après l’infection par COVID, avec un suivi à long terme de plusieurs participants. Study est actuellement en mesure de recruter à Victoria via le Royal Children’s Hospital et le Walter and Eliza Hall Institute. Les données FFX comprennent l’historique détaillé des vaccinations, les symptômes et les données des contacts familiaux dans les cas aigus de COVID, principalement des cas d’Omicron, et peuvent être adaptées pour un dépistage COVID long avec des contrôles à domicile.
  • Scientifique des virus Dre Sarah Lundrigan Elle a une collaboration de longue date (et un protocole approuvé par la recherche) avec le médecin respiratoire du Royal Melbourne Hospital, le professeur Daniel Steinfort – avec la capacité de prélever des échantillons de cellules épithéliales et immunitaires des voies respiratoires de patients à haut risque, y compris ceux atteints de coronavirus à long terme.
  • Le professeur Jody MacVernon a des liens avec le programme de recherche Patron de la Melbourne Medical School, une plate-forme dirigée par le professeur Lena Sanci pour surveiller les soins primaires – cette plate-forme pourrait être activée pour étudier le COVID à long terme, y compris dans les zones rurales et éloignées.
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2. Recommandations générales

  1. Les programmes qui favorisent la collaboration et les relations entre les institutions doivent être priorisés et financés explicitement, car les collaborations de recherche établies peuvent s’adapter pour répondre aux nouveaux défis et questions de la maladie.
  2. Les programmes de financement, de subventions, d’examen institutionnel interne, de promotion et de récompenses devraient élaborer des stratégies pour mesurer et récompenser la collaboration en tant que contribution importante à la préparation aux futurs défis des maladies infectieuses.
  3. Les capacités de la plate-forme de recherche doivent couvrir les domaines de la maladie (et les institutions), y compris l’infrastructure physique (par exemple, le laboratoire PC3 et les installations pour animaux, les installations de biobanque, etc.) et l’infrastructure numérique/administrative (par exemple, les accords de liaison de données, les systèmes de dossiers médicaux électroniques et les stratégies de gouvernance de la recherche). Il est constamment amélioré et priorisé pour les investissements.
  4. Les réponses multidisciplinaires réussies à la maladie (par exemple, les réponses à l’hépatite B et au VIH en Australie, l’intégration de la recherche clinique et des biobanques dans les soins cliniques standard au Royaume-Uni) doivent être explorées et étudiées pour fournir des conseils et une inspiration pour de nouvelles réponses aux maladies. Cela inclut l’engagement non seulement dans différentes disciplines académiques, mais aussi avec les organisations communautaires et d’expérience de vie, les gouvernements et les prestataires de services de santé.

3. Recommandations pour le COVID-19 à long terme

  1. Comprendre et caractériser le COVID prolongé en Australie constituera une contribution importante au niveau international puisque la plupart des infections étaient du SRAS-CoV-2 Omicron (et ses sous-variantes) et concernaient une population largement vaccinée.
  2. Cela nécessitera des cohortes plus importantes, représentatives et bien caractérisées pour faciliter la compréhension et l’étude de l’ensemble des conséquences à long terme de la COVID, notamment :
    • Prévalence et incidence en Australie
    • Symptômes cliniques du COVID aigu et prolongé
    • Détails de la variante SARS-CoV-2
    • statut vaccinal
    • Prélever des échantillons biologiques
  3. La nécessité de développer des modèles animaux de COVID-19 à action prolongée pour tester les interventions, mener des études comportementales et comprendre les causes de l’infection, y compris l’identification des signes vitaux.
  4. La nécessité de comprendre les modèles de soins efficaces, y compris la recherche-action pour identifier et améliorer les parcours de soins qui relient les soins primaires aux services spécialisés.
  5. Envisagez des stratégies et des cadres pour permettre la collecte (et l’accès à la recherche) de tissus post-mortem, y compris de tissus cérébraux, de personnes décédées après une COVID grave et prolongée.

Delphine Perrault

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