L’étude a révélé diverses différences dans le microbiote des tumeurs mammaires chez les femmes de différentes races

Selon une nouvelle étude menée par des chercheurs de Centre de cancérologie Johns Hopkins Kimmel.

Les biomarqueurs microbiens potentiels spécifiques à la race pour le cancer du sein identifiés par les auteurs sont associés à des gènes impliqués dans l’agressivité tumorale, la croissance vasculaire, la migration des cellules cancéreuses et les métastases, ainsi que les voies cancéreuses GLI1 et Notch. Une description des travaux a été publiée en ligne le 26 janvier dans la revue cancer du sein npj.

« Les facteurs régissant les disparités raciales dans le cancer du sein sont multifactoriels et peuvent inclure le statut socio-économique, l’accès aux soins primaires, les références en temps opportun, ainsi que la santé et la nutrition », explique l’auteur principal de l’étude. Deepali Sharma, Ph.D., professeur d’oncologie à la Johns Hopkins University School of Medicine et chercheur au John Fitting Breast Cancer Prevention Fund. « Cependant, il est important d’identifier des taux supplémentaires de ces différences. Notre étude démontre que le microbiome et les microenvironnements immunitaires des tumeurs du sein diffèrent également de manière significative entre les femmes de différentes races et peuvent être utilisés comme biomarqueurs pour prédire la progression de la maladie ou la réponse au traitement. »

Sharma et ses collègues ont examiné les données génomiques et métagénomiques de la cohorte Cancer Genome Atlas, qui comprenait 1 018 patientes atteintes d’un cancer du sein classées en groupes asiatiques (65 patientes), noires (257 patientes) et blanches (696 patientes) par auto-déclaration. Ils ont utilisé un outil Web appelé xCell pour analyser les signatures spécifiques de 64 cellules des tumeurs du sein chez les patientes et ont découvert que 11 types de cellules présentaient des différences très distinctes et statistiquement significatives entre les ethnies. Les différences cellulaires étaient les plus marquées entre les tumeurs des femmes noires et blanches, tandis que les tumeurs des femmes asiatiques et noires présentaient les différences les moins subtiles les unes par rapport aux autres.

Les chercheurs ont également noté une proportion plus élevée de cellules musculaires lisses parmi les tumeurs des femmes asiatiques par rapport aux femmes noires. Les adipocytes (les cellules qui composent le tissu adipeux) ont montré moins d’accumulation dans les tumeurs que les femmes asiatiques, mais un pourcentage significativement plus élevé dans les tumeurs que les femmes blanches. La proportion de cellules souches hématopoïétiques – les cellules qui donnent naissance à toutes les cellules sanguines et immunitaires – était significativement plus faible dans les tumeurs des femmes asiatiques que dans les tumeurs des femmes blanches, tandis que les cellules MEP et Th1 étaient significativement plus élevées dans les tumeurs des femmes asiatiques. L’interféron gamma, une substance importante pour l’immunité contre les infections, était plus élevé dans les tumeurs des femmes asiatiques, tandis que le CXCL9, une substance qui joue un rôle dans l’activation de l’immunité, était surexprimé dans les tumeurs des femmes noires. Ensemble, les changements associés au microenvironnement tumoral observés dans les tumeurs des femmes noires peuvent favoriser une progression tumorale agressive.

Dans des études analysant la composition de la communauté bactérienne parmi ces tumeurs, les chercheurs ont découvert que le microbiote des tumeurs mammaires des femmes asiatiques ne différait pas significativement de celui des femmes noires ou blanches. Cependant, les compositions des microbes dans les tumeurs mammaires des femmes noires et blanches variaient considérablement les unes des autres. Les biomarqueurs microbiens Acinetobacter, Citrobacter, Enterobacter, Staphylococcus, Paracoccus et Akkermansia étaient différemment abondants dans les tumeurs mammaires des femmes noires par rapport à celles des femmes blanches, tandis qu’Actinomyces et Veillonella étaient abondants dans les tumeurs mammaires des femmes blanches par rapport aux femmes noires. Pseudomonas et Methylobacter faisaient partie des biomarqueurs microbiens identifiés chez les femmes asiatiques.

De multiples voies et processus ont également été exprimés de manière différentielle dans les tumeurs des trois groupes ethniques. Par exemple, plusieurs voies oncogènes ont été significativement régulées à la hausse dans les tumeurs des femmes noires, y compris la signalisation mTOR, la signalisation calcique, Notch et la signalisation WNT. Les transporteurs ABC, connus pour être responsables du développement de la résistance à la chimiothérapie dans le cancer du sein, ont également été régulés positivement dans les tumeurs des femmes noires.

En examinant les profils d’expression génique, les chercheurs ont trouvé 394 gènes exprimés de manière différentielle entre les tumeurs des femmes asiatiques et noires. Environ 381 différaient entre les femmes noires et les femmes blanches, et 127 différaient entre les femmes asiatiques et les femmes blanches.

Enfin, les chercheurs ont recherché des associations entre les gènes et les biomarqueurs microbiens et ont découvert que le gène GLI1 était positivement associé à un type de bactérie appelé Terrabacter dans les tumeurs des femmes asiatiques et noires. Ces résultats indiquent un rôle possible des microbes dans le développement de l’angiogenèse tumorale et nécessitent donc des recherches plus approfondies, déclare le premier auteur Sheetal Pareda, PhD, associé de recherche au département d’oncologie de la faculté de médecine de l’Université Johns Hopkins.

Le groupe prévoit de valider ses découvertes dans un groupe plus large. Ils veulent également déterminer comment les microbes dans les tumeurs du sein influencent la progression de la maladie, ce qui pourrait être via des métabolites sécrétés, dit Sharma, et développer des biomarqueurs à base de microbes : « L’étude ouvre la voie à d’autres explorations alors que nous essayons de comprendre davantage tout ce réseau. . » mécaniquement. »

Les femmes blanches sont plus en danger de mort Avoir un cancer du sein (13 %), par rapport aux Indiens d’Amérique et aux Autochtones de l’Alaska (8 %), aux Asiatiques et aux îles du Pacifique (11 %), aux Noirs (12 %) et aux Hispaniques (11 %). Cependant, le risque de développer un cancer du sein chez les femmes noires de moins de 45 ans est 40% plus élevé que celui de leurs homologues blanches du même âge, note le journal.

Les autres co-auteurs de l’étude étaient Sumit Siddharth et Yuqing Chia de Johns Hopkins.

Les travaux ont été soutenus par le National Cancer Institute (R01CA204555), la Breast Cancer Research Foundation (90047965), le US Department of Defense Diriged Breast Cancer Research Program (BC191572, BC210668) et le Fetting Fund.