La nouvelle méthode de détection de la poliomyélite pourrait permettre une réponse plus rapide aux vaccins

Une nouvelle technologie a réduit de moitié le temps nécessaire pour détecter la polio, ce qui pourrait permettre une réponse vaccinale plus rapide aux épidémies et réduire le nombre global de cas de polio.

En permettant le séquençage génétique des échantillons de virus dans le pays d’origine de l’épidémie plutôt que leur envoi à des laboratoires spécialisés à l’étranger, les délais de détection pourraient être réduits d’une moyenne de 42 jours à 19 jours, selon des recherches menées en République démocratique du Congo ( RDC). Elle suggère.

« Ce gain de temps considérable peut conduire à des réponses plus rapides et à réduire la propagation et la propagation du poliovirus. »

Le Dr Alex Shaw est chercheur à l’École de santé publique de l’Imperial College de Londres

La polio est causée par un virus qui se transmet généralement par contact avec des matières fécales infectées via des aliments et de l’eau contaminés. Bien que de nombreuses personnes ne développent jamais de symptômes, l’infection peut entraîner une paralysie permanente ou la mort, et les nourrissons et les jeunes enfants sont les plus exposés. Les efforts visant à éradiquer la poliomyélite se poursuivent et l’Organisation mondiale de la santé a identifié les retards dans la détection comme un obstacle majeur à cet objectif, dans la mesure où cette maladie joue un rôle clé dans la gestion des épidémies.

Généralement, la polio est détectée en cultivant des cellules exposées au poliovirus dans des flacons de culture tissulaire, en les exposant à des virus collectés à partir d’échantillons de selles, puis en attendant de voir si elles meurent. Ce processus prend généralement environ une semaine, mais le test peut être répété pour garantir que l’échantillon est effectivement négatif pour le poliovirus.

Une fois détecté, une technique appelée réaction en chaîne par polymérase quantitative est utilisée pour tenter de déterminer si le virus est une souche dérivée d’un vaccin, un virus dérivé d’un vaccin qui a évolué pour être plus dangereux ou une forme sauvage de poliovirus – le résultat affectant le type. de la réponse requise.

Le Dr Alex Shaw, chercheur au Polio Research Center, a déclaré : « L’un des gros problèmes est que dans de nombreux pays, y compris la République démocratique du Congo, les laboratoires nationaux de poliovirus expédient leurs échantillons à un laboratoire mondial spécialisé qui effectue le séquençage. plutôt que de le faire. par elle-même ». School of Public Health de l’Imperial College de Londres, au Royaume-Uni, qui a dirigé la nouvelle étude. « Ce n’est qu’après avoir suivi tout ce processus que l’on peut déclencher une réponse, et plus il faudra de temps pour atteindre cette étape de réponse, plus le virus se propagera largement.

« La méthode basée sur la culture cellulaire n’est pas non plus conforme aux objectifs actuels de confinement de la polio. À mesure que nous nous rapprochons de l’éradication, nous ne voulons pas vraiment que les laboratoires produisent beaucoup de poliovirus, l’objectif est donc de s’éloigner de ce type de poliovirus. de détection pour les deux prochaines années. » .

Shaw est membre d’un effort international créé pour développer une méthode rapide et sans culture pour la détection de la polio, avec le soutien de la Fondation Bill & Melinda Gates. La méthode qu’ils ont développée, connue sous le nom de détection moléculaire directe et séquençage des nanopores (DDNS), fonctionne en amplifiant et en séquençant une région spécifique du génome du poliovirus qui code pour une protéine appelée VP1. « C’est la protéine qui permet au poliovirus d’attaquer les cellules humaines, elle définit donc essentiellement ce que la polio peut faire », a expliqué Xu.

En plus de détecter si le poliovirus est présent, cette séquence est comparée aux génomes de référence pour déterminer le type de poliovirus. Si la souche vaccinale est normale, une autre réponse n’est peut-être pas nécessaire, car il est habituel que cette forme inoffensive du virus soit excrétée dans les selles après des campagnes de vaccination orale. Cependant, la découverte du poliovirus de type sauvage, ou de la souche circulante dérivée du vaccin, déclenchera généralement une campagne de vaccination ciblée.

La République démocratique du Congo a été choisie comme premier pays à tester cette nouvelle méthode, car des poliovirus d’origine vaccinale y circulent toujours, avec 502 cas signalés en 2022. L’Institut national de recherche biomédicale (INRB) de Kinshasa a également beaucoup d’expérience dans ce domaine. . « Ils sont bien placés pour reprendre cette technologie, pour pouvoir l’utiliser et la maintenir, et disposent de l’expertise nécessaire pour gérer les données qui en découlent », a déclaré Xu.

Les scientifiques de l’INRB ont d’abord été formés à l’utilisation de la technologie via Microsoft Teams, puis ont passé six mois à tester la méthode en parallèle avec la méthode traditionnelle basée sur la culture cellulaire, permettant de comparer la précision des deux méthodes.

Recherche publiée dans la microbiologie naturelle, Nous avons constaté que les tests DDNS produisaient un résultat 23 jours plus rapidement que la méthode standard, avec des séquences générées précises à plus de 99 % par rapport à celles générées par la méthode standard.

« Ce gain de temps important peut conduire à des réponses plus rapides et réduire la propagation du poliovirus », a déclaré Xu. « Cela pourrait signifier que vous n’avez pas besoin de vacciner une vaste zone, et cela coûtera probablement moins cher car vous pourrez lancer des campagnes plus ciblées. »

La prochaine étape consiste à valider la technique sur un plus grand nombre d’échantillons et dans d’autres pays, notamment au Pakistan et au Nigeria, où la poliomyélite continue de se propager. Des scientifiques britanniques et l’INRB forment également des collègues dans d’autres pays, en prévision d’une éventuelle diffusion plus large de la technologie. Par exemple, l’institut a récemment organisé un cycle de formation pour des scientifiques du Sénégal, du Cameroun et du Kenya.

« La coopération et la formation avec nos partenaires ont permis à l’équipe locale non seulement de maîtriser et de mettre en œuvre en toute confiance cette nouvelle technologie, mais également de transférer des connaissances et des compétences », a déclaré le professeur Placid Mbala Kingibene, médecin et virologue à l’Institut international de recherche sur les virus. vers d’autres pays africains où des épidémies de poliovirus sont régulièrement signalées.

En dotant davantage de laboratoires des compétences nécessaires pour effectuer le séquençage et l’analyse génétiques, Qu espère également que les pays seront mieux placés pour répondre aux épidémies d’autres maladies, outre la polio. « Idéalement, à long terme, nous parviendrons à éradiquer la polio », a-t-il déclaré. « À ce stade, le réseau existant de laboratoires de polio, hautement qualifiés et très bien organisés, pourrait être réutilisé pour d’autres formes de surveillance de la maladie. »