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Des chercheurs de l’Université de technologie Chalmers ont conclu qu’un transfert génétique important entre les bactéries de nos écosystèmes et les humains peut être lié à des bactéries pathogènes chez les humains qui développent une résistance aux antibiotiques.
«Ces dernières années, nous avons vu des gènes de résistance se propager aux agents pathogènes humains à un degré beaucoup plus important que quiconque ne l’aurait imaginé», a déclaré Jan Zrimek, chercheur en biologie des systèmes et de synthèse à l’Université de technologie de Chalmers. De nombreux gènes semblent provenir d’une grande variété d’espèces et d’environnements bactériens, comme le sol, l’eau et les bactéries végétales. C’était difficile à expliquer car bien que la conjugaison soit très courante, nous pensions qu’il y avait des restrictions claires sur les espèces bactériennes qui pouvaient se transférer des plasmides entre elles.
Zrimek a noté que les plasmides appartiennent à différents groupes cinétiques, ou groupes MOB, pour ne pas basculer entre les espèces bactériennes. À cette fin, Zrimek a développé de nouvelles méthodes d’analyse des données qui montrent que le transfert de gènes peut être illimité et plus répandu que prévu.
Les chercheurs ont formulé un algorithme qui identifie les régions d’ADN spécifiques nécessaires à la conjugaison – appelées régions oriT – avec de grandes quantités de données constituées de séquences génétiques de l’ADN de milliers de plasmides.
Les travaux ont révélé que le nombre de régions oriT peut être environ huit fois plus élevé que celui trouvé par la méthode standard utilisée aujourd’hui; Le nombre de plasmides mobiles peut être le double de ce qui était auparavant connu; Et le nombre d’espèces bactériennes qui ont des plasmides mobiles peut être le double de ce que l’on savait auparavant.
«Ces résultats pourraient indiquer un solide réseau de transport de plasmides entre les bactéries chez les humains, les animaux, les plantes, le sol, les environnements aquatiques et les industries, pour n’en citer que quelques-uns», a déclaré Zrimek. « Cela peut être une raison possible du développement rapide de la résistance aux agents pathogènes humains que nous avons observée ces dernières années. »
