Les cas de Covid-19 en Nouvelle-Zélande augmentent rapidement, mais le nombre total d’infections est susceptible d’être beaucoup plus élevé – voici pourquoi

Analytique – Avec Aotearoa Nouvelle-Zélande Passons à la troisième étape De sa réponse à l’épidémie d’Omicron, de nouvelles définitions et protocoles de test et d’isolement signifieront de nouvelles façons de mesurer l’impact de Covid-19.

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Photo: RNZ / Dom Thomas

En général, il y a deux aspects à ce nouveau système. Le premier concerne les définitions changeantes de qui est considéré comme un contact étroit et quelles sont leurs exigences d’isolement.

La seconde concerne les processus de test, donnant des conseils sur qui doit être testé et quand, quel type de test ils doivent passer et comment marquer un score. Passer en phase III signifie passer à l’utilisation généralisée des tests antigéniques rapides (RAT).

La politique de dépistage est importante car le nombre de cas confirmés ou probables indique notre estimation du nombre d’infections primaires.

Les nouveaux cas confirmés sont un indicateur retardé des nouvelles infections, mais un indicateur avancé d’autres mesures importantes telles que l’hospitalisation. Plus nous en savons sur les personnes nouvellement infectées et sur leur localisation, mieux nous pouvons planifier les réponses individuelles et sociétales aux épidémies.

RAT et risques

Avec le grand nombre de cas que nous constatons actuellement avec Omicron, la rapidité est essentielle pour renvoyer les résultats des tests. Des résultats rapides signifient que les gens peuvent ajuster leur comportement en conséquence et s’isoler si nécessaire. Plus vite les gens obtiennent un résultat positif, plus vite ils peuvent signaler aux contacts récents, et ces personnes peuvent également être isolées.

Lorsque le nombre de cas est élevé, le risque d’un résultat faussement positif du RAT est très faible. Cela signifie que la valeur supplémentaire résultant d’un test PCR plus sensible est réduite par rapport au moment où nous avions un petit nombre de cas.

À l’inverse, lorsque le nombre de cas dans la communauté est élevé, il existe un risque de résultats faussement négatifs au RAT pour une personne qui présente des symptômes ou qui a été en contact étroit avec un cas confirmé.

Test antigénique rapide. (fichier image)
Photo: 123RF

Dans de tels cas, la marche à suivre judicieuse consiste à effectuer un deuxième test – soit un autre test RAT, soit un test PCR – et à supposer qu’il y a encore de bonnes chances que vous soyez infecté.

Les personnes sans exposition connue à un cas confirmé et sans symptômes peuvent être relativement confiantes dans l’exactitude d’un résultat RAT négatif. Quels que soient les résultats des tests, toute personne présentant des symptômes de type Covid doit s’isoler jusqu’à ce qu’elle se remette de ce qui cause ces symptômes, Covid-19 ou autre.

Estimation du nombre réel d’infections

La transition vers le stade 3 reconnaît que les infections et les cas confirmés sont suffisamment élevés pour que de nombreux processus de surveillance et de planification soient étirés et potentiellement imprécis.

À mesure que le nombre d’infections augmente, nous pouvons nous attendre à ce que le taux d’assurance des cas (CAR) commence à baisser. CAR est une mesure du pourcentage d’infections totales à un moment donné qui sont converties en cas confirmés.

Autrement dit, compte tenu du nombre de cas confirmés observés, combien d’infections pensons-nous réellement dans la communauté, y compris celles qui ne sont pas confirmées ?

Il est important de suivre cette métrique à différents stades d’une épidémie. À mesure que les exigences d’isolement pour les contacts étroits se relâchent, les infections peuvent augmenter, tandis que moins de personnes seront éligibles pour les tests.

Ou, les gens peuvent être testés positifs pour le RAT auto-administré mais ne pas le signaler. Les deux entraînent un nombre plus élevé d’infections non confirmées.

Pourquoi les chiffres exacts sont-ils importants

La seule façon d’estimer avec précision la République centrafricaine est par le biais d’une enquête sur la prévalence des infections. Un exemple est l’enquête de l’Office for National Statistics (ONS) du Royaume-Uni, l’un des aspects les plus forts de la réponse incomplète du Royaume-Uni à Covid-19.

Cette enquête aléatoire tente de mesurer directement la proportion de personnes infectées par le Covid-19 à un moment donné. Une enquête bien conçue garantit que des échantillons adéquats sont prélevés sur des personnes appartenant à différents groupes de population et présentant différents facteurs de risque d’infection.

La modélisation peut estimer le nombre d’infections dans différentes populations, en tenant compte de différentes hypothèses. Mais sans enquête sur la prévalence de l’infection, ou données équivalentes, seuls les cas confirmés peuvent être observés directement.

Étant donné que les cas confirmés constituent une partie inconnue des infections totales et que cette partie change avec le temps, il est important de pouvoir estimer avec précision le nombre d’infections de base pour valider une telle modélisation.

Et comme le nombre d’infections est un indicateur avancé des admissions à l’hôpital, il est précieux pour planifier des ajustements aux opérations ou aux politiques, comme les tests ou l’isolement.

La numérotation des cas fait partie de l’ensemble

Sans étudier la prévalence de l’infection, il est nécessaire de se référer à des mesures moins précises des estimations de l’infection.

Par exemple, la proportion de personnes hospitalisées testées positives au Covid-19 est une estimation peu fiable de la prévalence de l’infection car elle est biaisée par un grand nombre de facteurs difficilement contrôlables.

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Photo: Ministère de la Santé / Prestataire

À savoir, les gens viennent rarement à l’hôpital pour des raisons aléatoires. Bon nombre des mêmes facteurs qui peuvent entraîner des hospitalisations, même pour des raisons non directement liées au Covid-19, sont toujours liés au risque de contracter le Covid-19.

À titre d’exemple de données de prévalence d’infection en cours, début janvier 2022, le Royaume-Uni a enregistré une moyenne d’environ 200 000 cas confirmés par jour. Une enquête de l’ONS a estimé que moins de 4 millions de personnes étaient infectées à cette époque.

Les détails sur la durée de l’enquête au cours de laquelle les personnes peuvent avoir été testées positives peuvent affecter la valeur exacte de la CAR. Mais les chiffres du Royaume-Uni ne brossent un tableau que d’une petite partie des infections détectées, même si les RAT sont fournis fréquemment et gratuitement à chaque foyer.

Comme l’accès aux tests à Aotearoa devient plus limité qu’au Royaume-Uni, nous pourrions nous attendre à ce que notre CAR soit plus faible, et donc le nombre de cas signalés susceptible d’être nettement inférieur aux véritables infections.

Mais sans étudier la propagation de l’infection, il est difficile de dire exactement combien nous abandonnons.

*Dion O’Neill est le chef de projet chez COVID Modeling Aotearoa (qui reçoit un financement du Cabinet et du Département du Premier ministre), maître de conférences à l’Université d’Auckland et chercheur principal Te Puna Matatini. Te Matatini o te Horapa est un projet financé par le Health Research Council de Nouvelle-Zélande pour examiner les effets de Covid-19 sur l’équité à Aotearoa.