Le gène offre un certain niveau de protection contre le COVID-19 sévère

La première preuve d’un lien génétique qui explique pourquoi certaines personnes atteintes de Covid-19 ne tombent jamais malades a été découverte.

Une équipe scientifique et médicale dirigée par l’Université de Newcastle, au Royaume-Uni, a montré que le gène HLA-DRB1*04:01 est présent trois fois plus souvent chez les personnes asymptomatiques. Cela indique que les personnes porteuses de ce gène ont un certain niveau de protection contre le Covid-19 sévère.

L’étude, financée par Innovate UK, l’agence d’innovation du Royaume-Uni, a comparé des personnes asymptomatiques avec des patients de la même communauté qui avaient Covid mais n’avaient pas de maladie sous-jacente, et a été publiée dans HLA magazine.

L’équipe d’étude pense qu’il s’agit de la première preuve claire de résistance génétique, car cette étude a comparé des personnes gravement infectées à un groupe de COVID asymptomatiques et a utilisé le séquençage de nouvelle génération pour se concentrer en détail et largement sur les gènes HLA empilés sur le chromosome 6. D’autres études ont scanné l’ensemble du génome mais cette approche est moins efficace dans le complexe de typage tissulaire.

Les études à l’échelle du génome peuvent être comparées à une image satellite. La densité et la complexité élevées du complexe d’histocompatibilité et de la variance dans différentes populations signifient qu’une variance significative peut être négligée. Par exemple, différents allèles ou différentes versions du même gène peuvent avoir des effets opposés sur la réponse immunitaire. Cette étude était plus ciblée et comparait les symptômes aux asymptomatiques dans la même population et révélait les traits « protecteurs » de l’allèle.

On sait que le gène spécifique de l’antigène leucocytaire humain, HLA-DRB1*4:01, est directement lié à la latitude et à la longitude. Cela signifie que davantage de personnes en Europe du Nord et de l’Ouest sont susceptibles d’avoir ce gène.

Cela suggère que les populations d’ascendance européenne seraient plus susceptibles de rester asymptomatiques tout en transmettant la maladie aux populations sensibles.

Le Dr Carlos Echevarria de l’Institut de recherche translationnelle et clinique de l’Université de Newcastle, également consultant respiratoire à la NHS Foundation for Newcastle Hospitals et co-auteur de l’article, déclare : « C’est une découverte importante car elle peut expliquer pourquoi il y a certains les personnes qui contractent le Covid mais ne tombent pas malades.

« Cela pourrait nous conduire à un test génétique qui pourrait indiquer qui nous devons prioriser pour les futures vaccinations. »

« Au niveau de la population, c’est important pour nous de savoir car quand on a beaucoup de gens qui sont résistants, ils contractent le Covid mais ne présentent pas de symptômes, ils risquent de propager le virus et ils sont asymptomatiques. »

L’effet de l’association des gènes avec la géolocalisation est un concept scientifique accepté et il est bien connu que les gènes HLA évoluent d’une génération à l’autre en réponse à des agents pathogènes pathogènes.

L’auteur de l’étude, David Langton, dont la société ExplantLab a aidé à financer l’étude par le biais de l’Innovate UK Research Award, a ajouté : « Certaines des découvertes les plus intéressantes ont été les relations entre la latitude, la longitude et la fréquence du gène HLA. On sait depuis longtemps que l’incidence de la sclérose en plaques augmente avec l’augmentation de la latitude Ceci a été partiellement réduit pour réduire l’exposition aux UV et donc des niveaux plus faibles de vitamine D. Cependant, nous ne savions pas que l’un des principaux gènes de risque de SEP, DRB1*15:01, est directement lié à la latitude .

« Cela met en évidence l’interaction complexe entre l’environnement, la génétique et la maladie. Nous savons que certains gènes HLA répondent à la vitamine D et que de faibles niveaux de vitamine D sont un facteur de risque de COVID-19 sévère et nous travaillons davantage dans ce domaine. « 

L’étude a utilisé des échantillons de 49 patients atteints de COVID-19 sévère qui ont été hospitalisés pour insuffisance respiratoire, des échantillons d’un groupe asymptomatique de 69 travailleurs hospitaliers qui ont été testés positifs lors de tests sanguins d’anticorps sanguins de routine et un groupe témoin d’une étude sur la relation entre les génotypes HLA et Résultats de la chirurgie de remplacement articulaire.

La recherche a utilisé des machines de séquençage de nouvelle génération pour étudier en profondeur les différentes versions, ou allèles, des gènes HLA qui ont été combinées à une variété d’expériences et de modélisations. Les travaux ont été limités à des échantillons du nord-est de l’Angleterre pendant le premier verrouillage, ce chiffre est faible dans les groupes d’étude, mais des études supplémentaires seront nécessaires au Royaume-Uni et dans d’autres populations car il peut exister différentes copies des gènes HLA offrant une résistance dans d’autres populations.

Le travail était une collaboration entre l’Université de Newcastle, le NHS Foundation Trust for Newcastle Hospitals, le NHS Foundation Trust for Northumbria Healthcare, le James Cook University Hospital et le NHS Foundation Trust for North Tees et Hartlepool.

Le SRAS Cov-2 est l’une des plus grandes menaces pour l’humanité. Plus nous comprenons pourquoi certaines personnes tombent malades, mieux nous pourrons nous défendre contre ce virus et d’autres à l’avenir.

Sir John Byrne, co-auteur, professeur de génétique clinique à l’Université de Newcastle