Les chercheurs de Centre de cancérologie complet UNC Lineberger Elle a fait un grand pas en avant en intégrant deux méthodes principales d’étude du cancer du sein : l’une par analyse génétique et l’autre en s’intéressant à la structure des cellules ou à leur pathologie. Les chercheurs ont pu relier les deux grâce à un effort d’une décennie rendu possible par des ressources financées par le gouvernement fédéral pour l’ensemble de données de l’Atlas du génome du cancer du sein (TCGA) pour le cancer du sein. Les scientifiques ont trouvé un grand accord entre les classifications génétiques et les maladies, mais ils ont développé une nouvelle façon d’utiliser les données des deux systèmes pour proposer une méthode de classification qui divise le cancer du sein en 12 groupes biologiques distincts.
Les résultats sont parus le 8 décembre 2021 à Génomique cellulaire.
Il a déclaré: « Nous savons depuis longtemps que le cancer du sein n’est pas une maladie unique, et maintenant, grâce à des années de recherche moléculaire, ainsi qu’à des décennies de connaissances en pathologie, nous commençons à intégrer les deux dans un seul langage. » Charles Perrault, Ph.D., co-directeur du programme de recherche sur le cancer du sein à l’Université de Caroline du Nord, professeur distingué Mayo-Goldman Shaw en oncologie moléculaire et auteur correspondant de la recherche. « Cela aiderait grandement les futurs efforts de recherche et permettrait une traduction plus rapide des découvertes moléculaires au laboratoire de pathologie pour une utilisation clinique. »
L’Organisation mondiale de la santé a longtemps classé les tumeurs du sein en plusieurs types en fonction de la forme, de la structure et de la taille uniques de la cellule tumorale. Le type de cancer du sein le plus courant a été défini comme le carcinome canalaire invasif. Il représente 70 à 80 % de tous les cancers du sein. Bien que ce type prédominant de cancer du sein ait intéressé les chercheurs, ce sont les types rares qui ont occupé la plus grande opportunité de nouvelles découvertes dans cette découverte.
Le référentiel de tissus de TCGA contenant plus de 10 000 types de 33 types de cancer différents a permis aux chercheurs d’explorer des maladies du sein connues, mais rares. Cependant, l’obtention d’un nombre suffisant d’échantillons pour étudier les types et sous-types rares de cancer a été un défi. Mais l’équipe du TCGA sur le cancer du sein, dirigée par le Pérou, a pu obtenir suffisamment d’échantillons pour au moins six sous-types rares de cancer du sein, chacun présentant des caractéristiques moléculaires uniques et intéressantes.
On notera en particulier les rares carcinomes métaplasiques, un sous-type de cancer du sein de mauvais pronostic clinique. En comparant avec la cohorte complète de 10 000 tumeurs du TCGA, les chercheurs ont découvert que certains cancers métaplasiques étaient étroitement liés aux mélanomes, qui sont des cancers agressifs de la peau, et aux sarcomes, que l’on trouve couramment dans les os et le tissu conjonctif.
« Nos efforts complètent toutes les analyses prévues sur TCGA, ce qui a été une entreprise majeure », a déclaré Aatish Thennavan, un étudiant diplômé du laboratoire du Pérou et premier auteur de l’article. « Dans notre étude, nous avons validé nos résultats en utilisant d’autres ensembles de données qui contiennent également des sous-types rares. Nous exhortons les futures études à incorporer des sous-types rares afin que nous puissions nous appuyer sur cette analyse fondamentale. »
Dans leur prochain effort, les chercheurs prévoient d’approfondir les caractéristiques moléculaires et les origines cellulaires des cancers du sein métaplasiques. Ils s’intéressent également aux raisons pour lesquelles certains des 12 groupes biologiques présentent des preuves de cellules immunitaires capables d’infiltrer les cellules cancéreuses, et pourquoi d’autres ont tendance à ne pas en avoir. Ce type de recherche a des implications thérapeutiques car il existe des traitements développés qui ciblent les cellules immunitaires dans les cancers du sein.
Référence: Aatish Thennavan A, Beca F, Xia Y et al. Analyse moléculaire des types histologiques du cancer du sein TCGA. Génomique cellulaire. 2021: 10.1016 / j.xgen.2021.100067
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