La propagation du SRAS-CoV-2 au cours de la période initiale d’émergence du variant Omicron du SRAS-CoV-2 en Finlande

Une étude récente a été publiée dans medRxiv* Le serveur de prépresse a présenté l’augmentation rapide de la séroprévalence de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) lors de l’émergence de la variante Omicron en Finlande.

Contexte

La variante SARS-CoV-2 du syndrome respiratoire aigu sévère (COV) est apparue fin 2021. Elle a changé l’épidémiologie de l’épidémie de SARS-CoV-2 en cours avec une augmentation rapide des cas de COVID-19 dans le monde. Le 29 novembre^yEn 2021, le premier cas de la variante SARS-CoV-2 Omicron a été détecté en Finlande. Cependant, les données sur la prévalence et l’exposition à l’omicron au cours des premiers mois de l’émergence de l’omicron en Finlande ne sont pas cohérentes.

sur les études

Dans la recherche actuelle, les scientifiques ont évalué les changements de prévalence et d’exposition au COVID-19 au cours de la période initiale de SARS-CoV-2 Omicron VOC dans la grande région d’Helsinki, en Finlande. L’équipe a effectué une évaluation séro-épidémiologique potentielle de COVID-19 sur 1 600 échantillons de sérum de routine livrés au laboratoire de l’Université d’Helsinki (HUSLAB) pour les sérums du virus de l’immunodéficience humaine (VIH). Cette analyse a été menée entre le 15 novembre^yEt 2021 et le 6 mars^y2022.

L’étude actuelle a commencé à 46 semaines civiles en 2021 et s’est terminée à neuf semaines civiles en 2022. Un total de 100 échantillons de sérum ont été sélectionnés au hasard et testés pour les anticorps anti-immunoglobuline G (IgG) du SRAS-CoV-2 contre le domaine de liaison au récepteur viral (RBD) protéines spike 1 (S1) et une nucléocapside (N). De plus, les protéines S1 et N ont été dosées avec SARS-CoV-2 IgG II Quant (protéine S) et Abbott SARS-CoV-2 IgG (protéine N), respectivement, pour chaque semaine civile de l’étude.

Des échantillons ont été sélectionnés pour chaque semaine civile par sélection aléatoire du point de départ et sélection systématique d’échantillons jusqu’à 100 échantillons, et cinq échantillons supplémentaires ont été obtenus. Ensuite, 100 échantillons sélectionnés ont été évalués pour les anticorps COVID-19. Si la taille de l’échantillon est insuffisante ou si l’examen échoue, l’échantillon est remplacé par l’un des échantillons supplémentaires correspondant à cette semaine civile.

Les auteurs ont estimé le pourcentage de sous-groupes spécifiques en fonction du statut sérique pour chaque semaine civile. L’analyse statistique de l’étude a été réalisée à l’aide du programme IBM Statistical Package for the Social Sciences (SPSS).

conséquences

Les résultats de l’étude ont montré que les sous-groupes issus de l’évaluation du statut sérologique des échantillons étaient 1) anti-S1 négatif/anti-N négatif, 2) anti-S1 positif/anti-N négatif, 3) anti-S1 positif/anti -N positif, et 4) anti-S1 négatif/anti-N positif. Ces quatre sous-groupes indiquent respectivement 1) aucune preuve sérologique d’une infection antérieure par le SRAS-CoV-2 ou d’une immunisation vaccinale ; 2) aucune preuve de COVID-19 récent mais une réponse sérologique à la vaccination était présente, 3) compatible avec un statut vaccinal antérieur inconnu, et 4) aucune preuve de vaccination mais une infection récente possible.

L’âge moyen des participants à l’étude était de 33 ans et plus de 55 % de la population incluse dans cette recherche étaient des femmes. Au cours des cinq premières semaines de l’étude, la prévalence des anticorps SARS-CoV-2 N était de 5,2 %, tandis qu’au cours des cinq dernières semaines, elle est passée à 28,2 %. Dans les mêmes horodatages, les pourcentages d’échantillons de sérum SARS-CoV-2 ont diminué de 11,6 % à 3,8 %, et les échantillons négatifs anti-S1/anti-N ont diminué de 84,2 % à 68,2 %.

Chez les personnes de moins de 30 ans, une augmentation significative de la séroprévalence des anticorps N a été détectée au cours de la période de recherche. La séroprévalence des anticorps N était continuellement inférieure à 10% à la fin de 2021, mais a montré une augmentation rapide à la première semaine de 2022 et a dépassé 20% à la troisième semaine de 2022.

Les échantillons négatifs anti-N/anti-S1 ont commencé à apparaître à partir de la semaine 2 en 2022 et constituaient 0,9 % de tous les échantillons étudiés, ce qui peut indiquer une séroréactivité retardée ou réduite à S1 dans l’infection à omicron. Le pourcentage décroissant d’échantillons de sérum du groupe 1 vers la conclusion de l’étude a montré l’augmentation des échantillons positifs anti-N dans les groupes 3 et 4.

Omicron est devenu la variante dominante du SRAS-CoV-2 dans la grande région d’Helsinki à la mi-décembre 2021. Les résultats ont montré une baisse rapide de l’exposition individuelle au SRAS-CoV-2, indiquant un taux élevé de transmission du COVID-19. Cette observation est cohérente avec les enquêtes précédentes sur ce sujet. Environ 4 % des participants avaient des taux sériques de SARS-CoV-2 S et N à la fin de la recherche. Environ 78 % des volontaires de l’étude ont montré des anticorps N anti-SARS-CoV-2 S/no, reflétant l’immunisation virale du vaccin COVID-19/sans infection récente.

conclusion

Les résultats de l’étude montrent que la prévalence des anticorps SARS-CoV-2 N a augmenté rapidement de 5,2 % entre 46 et 50 semaines en 2021 à 28,2 % entre cinq et neuf semaines en 2022 au cours de la période de recherche. Ces données indiquent qu’environ 23 % des sujets ont été infectés par le SRAS-CoV-2 au cours de la période d’étude. Cependant, le pourcentage d’échantillons séropositifs et anti-S1-positif/anti-N-négatif a diminué. Les échantillons anti-N-positifs négatifs pour les anticorps anti-S1 ont commencé à apparaître dès la deuxième semaine de 2022.

Dans l’ensemble, l’étude dépeint une augmentation significative de la prévalence de l’anticorps SARS-CoV-2 N au cours de la période initiale d’émergence d’Omicron en Finlande, reflétant le taux de transmission élevé de COVID-19. De plus, les résultats ont montré que lors de l’apparition d’Omicron VOC dans la grande région d’Helsinki, en Finlande, un nombre important de patients COVID-19 n’avaient pas été diagnostiqués. Les auteurs ont proposé l’infection subclinique SARS-CoV-2 et les analyses réduites de réaction en chaîne inverse de transcription-polymérase (RT-PCR) comme raisons de cette observation.

*Remarque importante

medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui n’ont pas été évalués par des pairs et ne doivent donc pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou être traités comme des informations établies.