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Un nouveau logiciel met en évidence des souris modèles d’autisme grinçantes | Domaine

grincement de: Un nouvel outil logiciel qui analyse les couinements des rongeurs en fonction des sources d’appels et des cibles visées.

les gens parlent; les souris grincent. Mais les rongeurs communiquent également par le biais de sons ultrasonores inaudibles, qui donnent un aperçu de leur comportement social. Un nouvel outil logiciel appelé TrackUSF pourrait aider les chercheurs à collecter des données échographiques en enregistrant les sons et en détectant les différences entre eux, selon de nouvelles recherches. étude.

Si les ultrasons sont solides Analogues des capacités de communication des personnes En cours de discussion, mais l’outil pourrait aider à la recherche de modèles animaux d’autisme ; Tel que La prononciation est modifiée Des recherches antérieures ont trouvé des animaux qui ont des mutations génétiques liées à l’autisme.

TrackUSF utilise une approche souvent utilisée par les logiciels de reconnaissance vocale humaine : identifier les signatures et les comparer les unes aux autres, explique le chercheur principal Shlomo Wagnerprofesseur agrégé de neurosciences et de comportement social à l’Université de Haïfa en Israël.

L’idée de TrackUSF est l’analyse de signature [ultrasonic vocalizations] Émis par différents groupes d’animaux, tels que [autism] Les modèles et leurs collègues sauvages, pour les comparer et identifier les différences entre eux, dit-il.

Wagner et son équipe ont classé les signatures à l’aide d’une échelle appelée coefficients cepstraux à pente de fréquence (MFCC). Les paramètres sont censés représenter ce que l’auditeur entend réellement, et ils correspondent à des sons de fréquences différentes divisés en unités distinctes.

Wagner dit que les avantages de TrackUSF sont qu’il peut être utilisé pour n’importe quelle condition, sur plusieurs animaux à la fois, et les utilisateurs n’ont généralement pas besoin de formation explicite. « De plus, contrairement aux outils précédents, TrackUSF peut être utilisé pour d’autres animaux que les rats et les souris, comme les chauves-souris. »

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OAlors que certains outils d’analyse de la parole nécessitent que des experts les forment très tôt sur des échantillons audio de référence ou de base, TrackUSF est conçu pour identifier les changements de prononciation entre les groupes sans aucune formation préalable, explique Wagner.

groupes vocaux: Certains types de prononciation de rat ont montré des modèles clairs basés sur les sources et les destinataires prévus, tandis que d’autres étaient moins cohérents.

À cette fin, lui et son équipe ont testé l’outil sur des souris et des rats de type sauvage qui avaient perdu une ou les deux copies du gène SHANK3 lié à l’autisme. Au cours de 109 sessions d’enregistrement, TrackUSF a classé les appels d’animaux en groupes distincts, regroupés à la fois par l’animal qui prononce l’énoncé et par l’auditeur prévu. Par exemple, les souris de type sauvage et SHANK3 ont tendance à émettre des sons similaires lorsqu’elles communiquent avec leurs compagnons, mais pas lorsqu’elles communiquent avec des souris inconnues.

Adapter les techniques d’analyse de la voix humaine pour les utiliser avec les couinements des rongeurs pose des problèmes en matière de traitement des sons, dit-il Ryōsuke TachibanaD., professeur agrégé de neurosciences comportementales à l’Université de Tokyo, au Japon, n’a pas participé aux travaux. « Le MFCC se concentre sur les modèles de résonance de fréquence dans le tractus vocal en utilisant les structures harmoniques du signal », ce qui en fait une bonne unité de mesure pour analyser la voix humaine, dit-il, mais en ce qui concerne les vocalisations de souris, qui ne sont généralement pas ‘t ont des harmoniques, ce n’est peut-être pas la meilleure mesure.

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TrackUSF n’a pas été conçu pour caractériser en détail les vocalisations ultrasonores, note Wagner. Mais même un test de haut niveau peut être utile pour les chercheurs à la recherche de tout changement dans les caractéristiques de base chez la souris.

« Par exemple, une société pharmaceutique pourrait l’utiliser pour examiner sa bibliothèque de médicaments et trouver lequel des médicaments restaure la vocalisation normale chez les souris SHANK3, indiquant des traitements médicamenteux potentiels pour le syndrome de Phelan-McDermid », dit-il. « Tout ce dont ils ont besoin, c’est de mettre des microphones à ultrasons dans les cages des animaux et d’utiliser TrackUSF pour l’analyse. »

Citer cet article : https://doi.org/10.53053/QROX5528

Delphine Perrault

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