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Qu’est-ce que la nouvelle variante Omicron XE et dois-je m’inquiéter ?

Il semble que toutes les quelques semaines, nous entendons parler d’une nouvelle variante de COVID, et il est difficile de savoir à quel point nous devrions être anxieux.

Une variante « recombinante » appelée « Omicron XE » est apparue, qui est le résultat de la fusion de deux souches d’Omicron dans un hôte, puis de la transition vers l’infection des autres.

Alors, que savons-nous de ce nouvel hybride, et devrions-nous nous inquiéter ?



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Un peu sur Omicron et ses variantes

Omicron est un type de virus SARS-CoV-2 qui existe depuis découvert pour la première fois Au Botswana le 11 novembre 2021 et Nommer une variable préoccupante par l’Organisation mondiale de la santé le 26 novembre. Depuis ce temps, il a été déplacé dans le monde entier et a remplacé Delta pour devenir la variante dominante.

Depuis lors, Omicron a continué d’évoluer pour avoir de nombreuses lignées différentes ou sous-variantes génétiquement liées. Cela inclut l’Omicron BA.1 original (B.1.1.529) ainsi que BA.2 et BA.3.

BA.2 est plus contagieux de BA.1 et a maintenant repris ou dépassé BA.1 pour devenir la nouvelle forme dominante de SARS-CoV-2 dans le monde, avec l’OMS officiellement annoncé Ce sera le cas le 22 mars 2022.

Les différences que nous avons constatées avec Omicron par rapport aux variantes précédentes s’expliquent par le nombre relativement important de mutations qu’il a acquises, avec 60 mutations non trouvées dans le virus d’origine provenant de Wuhan, en Chine.

Parmi ces mutations, 32 sont des modifications génétiques de la protéine Spike. La protéine de pointe fait partie du virus qu’elle utilise pour se lier aux cellules humaines, ainsi que la cible de la réponse immunitaire contre le virus, qu’elle provienne de vaccins ou d’infections antérieures.

BA.2 partage autant de ces mutations que la variante originale d’Omicron, mais possède également 28 modifications génétiques uniques. Quatre de ces modifications génétiques sont présentes dans la protéine de pointe, ce qui explique pourquoi certaines de ses propriétés diffèrent de la variante originale d’Omicron (BA.1), notamment le fait qu’elle semble être d’environ 30 à 50 %. plus contagieux de BA.1.



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BA.2 en tant que sœur d’Omicron. Voici ce que nous savons d’elle jusqu’à présent


C’est quoi « recombinant » ?

Tout comme nous avons vu l’émergence de nouvelles variantes, suivie de l’évolution de différentes sous-variantes ou souches, le SRAS-CoV-2 a également continué à changer d’autres manières. Récemment, nous avons non seulement observé des changements spontanés dans le code génétique qui ont provoqué les changements ci-dessus, mais aussi le soi-disant recombinant.

Recombinant est l’endroit où des virus apparentés échangent du matériel génétique pour former une progéniture avec du matériel génétique des deux virus parents. Cela peut se produire lorsque des virus de deux souches différentes (ou variantes ou sous-variantes) infectent la même cellule.

Le matériel génétique des virus peut être mélangé et assemblé pour créer un nouveau virus recombinant avec les caractéristiques de l’un ou des deux virus parents. En conséquence, les caractéristiques du virus recombinant dépendent des parties du matériel génétique des virus parents que vous insérez dans la nouvelle version – tout comme vous pourriez avoir le nez de votre mère et les genoux de votre père.

Une personne peut être infectée par deux souches du virus, et elles se combinent pour former une nouvelle souche.
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Lors de la recombinaison de Delta et Omicron, la souche résultante a été appelée « Deltacron » (bien que formellement appelée XD et XF). Ce type de recombinant a été identifié pour la première fois en France à la mi-février et semble avoir La séquence génétique est essentiellement la même que celle de delta, mais avec des aspects de la protéine de pointe d’Omicron BA.1.

Alors, qu’est-ce que XE et où se propage-t-il ?

XE est une réintégration de BA.1 et BA.2. Il existe plusieurs combinaisons BA.1 et BA.2, notamment XQ du Royaume-Uni, XG du Danemark, XJ de Finlande et XK de Belgique.

Bien que XE représente encore une petite proportion du nombre total de cas séquencés, il a montré des preuves de transmission communautaire, du moins en Angleterre où il a été détecté pour la première fois à la mi-janvier. Il y avait maintenant un peu plus 1100 caisses inscrit.

Il a également été identifié en Inde, en Chine et en Thaïlande. Au début, le taux de croissance de XE ne semblait pas différer significativement de BA.2, mais des données plus récentes du Royaume-Uni indiquent qu’il a Taux de croissance D’environ 10 à 20% supérieur à BA.2.

Ces données restent préliminaires et sont basées sur de petits nombres, elles peuvent donc changer à mesure que nous obtenons plus d’informations. Si c’est vrai, alors XE était probablement légèrement plus contagieux que BA.2, qui était légèrement plus contagieux que BA.1, qui était légèrement plus contagieux que Delta.

Avons-nous besoin de nous inquiéter ?

Notre réponse immunitaire qui aide à protéger contre le COVID-19 est générée par la vaccination ou par une infection antérieure, et elle cible principalement la protéine de pointe. Étant donné que XE contient essentiellement la même protéine de pointe que BA.2, notre protection contre XE ne semble pas significativement réduite.

Bien que ce soit quelque chose que les agences de santé publique et les groupes d’experts devraient certainement surveiller, et ce n’est pas vraiment quelque chose d’inattendu étant donné le nombre de cas que nous voyons encore dans le monde. Cela ne devrait donc pas être une préoccupation supplémentaire pour le grand public.

La meilleure façon de ralentir l’émergence de nouvelles variantes, ainsi que des recombinants, est d’avoir plus de personnes dans le monde protégées par la vaccination afin de réduire la gamme d’hôtes sensibles chez lesquels ces événements peuvent se produire.

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Delphine Perrault

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