Le virus du saumon originaire de l’Atlantique s’est propagé au saumon sauvage de la Colombie-Britannique à partir d’élevages : une étude
L’orthoréovirus de piscine (PRV) – lié à des lésions rénales et hépatiques chez le saumon quinnat – circule constamment entre les fermes salmonicoles en réseau ouvert et les jeunes saumons quinnat dans les eaux de la Colombie-Britannique, selon une nouvelle analyse génomique publiée aujourd’hui dans progrès scientifique.
L’étude collaborative de l’Université de la Colombie-Britannique (UBC) et de la Strategic Salmon Health Initiative (SSHI) – un partenariat entre Pêches et Océans Canada (MPO), Genome BC et la Pacific Salmon Foundation – retrace les origines du PRV dans les fermes de saumon de l’Atlantique en Norvège et constate que le virus est omniprésent. Presque dans les fermes salmonicoles en Colombie-Britannique
Il montre également que le saumon quinnat sauvage est d’autant plus sensible au PRV qu’il est proche des fermes salmonicoles, ce qui suggère que les fermes transmettent le virus au saumon sauvage.
Le séquençage du génome des virus des poissons d’élevage et sauvages indique en outre que la transmission se produit entre le saumon d’élevage et le saumon sauvage.
« Notre méthode génétique et épidémiologique est arrivée indépendamment à la même conclusion, que les fermes salmonicoles agissent comme une source et un amplificateur pour la transmission du PRV », a déclaré le Dr Gideon Mordechai, écologiste viral et boursier Liber Ero à l’UBC Science et chercheur en médecine à l’UBC. . qui a dirigé l’étude. « Étant donné que des lignes distinctes de preuves indépendantes pointent toutes vers la même réponse, nous sommes confiants dans notre conclusion. »
Le séquençage de 86 génomes de PRV a aidé les chercheurs à retracer l’histoire de l’émergence du PRV en Colombie-Britannique. Ils ont estimé que les lignées de PRV dans le Pacifique Nord-Est divergeaient de PRV dans l’Atlantique il y a environ 30 ans. Cela indique que l’introduction du PRV en Colombie-Britannique et l’infection du saumon sauvage du Pacifique est un phénomène relativement récent, coïncidant avec la croissance de la salmoniculture dans la province – qui ne remonte pas aux premières tentatives d’introduction du saumon de l’Atlantique dans la région, à partir de 1874.
Le Dr Emiliano de Sico et le Dr Andrew Bateman (co-auteurs de l’étude) ont échantillonné du saumon sauvage dans l’océan Pacifique. Crédit : Amy Romer
« Il y a beaucoup de confusion sur l’origine du PRV, s’il est transmis entre le saumon d’élevage et le saumon sauvage, et comment différentes souches du virus provoquent différents degrés de maladie », a déclaré le Dr Mordechai. « Le séquençage du génome de cette étude indique clairement que le PRV n’est pas originaire des eaux de la Colombie-Britannique – il est originaire de l’Atlantique et s’est répandu dans le monde entier grâce à la salmoniculture. »
L’étude met en évidence le rôle de l’aquaculture dans l’introduction de nouveaux agents pathogènes dans de nouvelles zones, où ils se propagent ensuite aux poissons sauvages, et intègre l’expertise des auteurs principaux, la Dre Kristi Miller, scientifique du MPO et le professeur Jeffrey Joy, généticien évolutionniste à l’Université de la Colombie-Britannique. . Il démontre la valeur de la génomique dans la surveillance des agents pathogènes viraux affectant d’importantes ressources halieutiques et comment les méthodes analytiques dérivées de l’épidémiologie des virus humains peuvent être adaptées et appliquées au maintien des populations de saumon sauvage.
Une analyse plus poussée des génomes du PRV résultant de l’étude a suggéré qu’il y a eu une augmentation du nombre d’infections à PRV en Colombie-Britannique au cours des dernières décennies. Cette constatation concorde avec la croissance régionale de la salmoniculture et des taux plus élevés d’infection virale dans les fermes salmonicoles.
« Notre découverte selon laquelle le PRV se transmet entre le saumon d’élevage et le saumon sauvage est particulièrement pertinente étant donné les récentes études sur le terrain et en laboratoire montrant que les lignées de PRV en Colombie-Britannique causent probablement des maladies chez le saumon du Pacifique et de l’Atlantique », explique le Dr Mordechai.
Une récente étude norvégienne a révélé qu’un isolat canadien du virus provoque des lésions cardiaques chez le saumon de l’Atlantique. Plus important encore pour l’écosystème du Pacifique, le PRV a été associé à une maladie différente chez le saumon quinnat dans laquelle les cellules sanguines se rompent, entraînant des dommages aux reins et au foie. Cela contraste avec l’évaluation du MPO selon laquelle le PRV n’est pas un facteur de maladie.
« Notre étude réaffirme la nécessité d’une approche plus prudente de la gestion de la salmoniculture en Colombie-Britannique », a déclaré le co-auteur de l’étude, le Dr Andrew Pittman, de la Pacific Salmon Foundation. « Les résultats du PRV, en particulier, soutiennent les appels à une transition de l’élevage ouvert du saumon vers une technologie d’élevage qui ne permet pas la transmission de maladies entre le saumon d’élevage et le saumon sauvage, protégeant le saumon sauvage de la Colombie-Britannique des risques graves dans le processus. »
Langue(s) de l’entretien : anglais
