Billes d’immobilisation inverse en phase solide pour la construction d’une bibliothèque de séquençage d’ADNr à haut débit

Les billes d’immobilisation inverse en phase solide (SPRI) sont largement utilisées pour la construction de bibliothèques de séquençage à haut débit pour la purification et la récupération des acides nucléiques. une Nouvelle étude Publié dans Maladies zoonotiques étudié les effets du rapport de billes SPRI, du temps d’incubation et du temps d’élution sur la récupération de l’ADN lors de la construction d’une bibliothèque de séquençage à haut débit d’ADNr 16S complet.

Les effets de différents ratios de billes SPRI, temps d’incubation et temps d’élution ont été comparés pour trois quantités différentes d’échantillons primaires. L9(3³) Une expérience orthogonale a été conçue pour déterminer la combinaison optimale de ces facteurs.

Le temps d’incubation de trois facteurs, notamment le rapport des billes SPRI, le temps d’incubation et le temps d’élution, a eu un effet statistiquement significatif sur le taux de récupération pour la quantité initiale d’échantillon de 1 500 ng et 3 000 ng. Les résultats de l’expérience orthogonale ont indiqué que le temps d’incubation avait l’effet le plus important parmi les trois facteurs.

Le temps d’incubation affecte grandement le taux de récupération dans la construction d’une bibliothèque de séquençage à haut débit d’ADNr 16S pleine longueur. L’utilisation de billes SPRI 0,8 ×, 15 min d’incubation et 10 min d’élution ont abouti au taux de récupération le plus élevé. Les billes SPRI constituent une méthode viable pour récupérer des amplicons d’ADNr 16S complets.